Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04219 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04219 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04219 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04219 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04219 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04219 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04219 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04219 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04219 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04219 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04219 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04219 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04219 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04219 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04219 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04219 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04219 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04219 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04219 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P04219 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04219 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04219 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04219 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04219 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04219 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04219 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms