Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B2mP01887 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B2mP01887 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B2mP01887 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
B2mP01887 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B2mP01887 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B2mP01887 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B2mP01887 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B2mP01887 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B2mP01887 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B2mP01887 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B2mP01887 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B2mP01887 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B2mP01887 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B2mP01887 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B2mP01887 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B2mP01887 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.6 ms