Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01649 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01649 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01649 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01649 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
P01649 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01649 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01649 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01649 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01649 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01649 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01649 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01649 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01649 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01649 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01649 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01649 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms