Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Setdb1O88974 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setdb1O88974 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Setdb1O88974 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms