Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apaf1O88879 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apaf1O88879 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms