Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tom1O88746 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tom1O88746 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tom1O88746 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tom1O88746 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tom1O88746 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1O88746 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1O88746 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1O88746 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Tom1O88746 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms