Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sap30O88574 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sap30O88574 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sap30O88574 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sap30O88574 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sap30O88574 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sap30O88574 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sap30O88574 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sap30O88574 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sap30O88574 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sap30O88574 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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