Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a3O88561 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a3O88561 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms