Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vti1bO88384 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms