Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnnt1O88346 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnnt1O88346 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms