Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm10226O88253 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm10226O88253 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm10226O88253 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm10226O88253 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm10226O88253 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm10226O88253 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm10226O88253 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm10226O88253 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm10226O88253 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm10226O88253 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm10226O88253 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm10226O88253 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm10226O88253 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm10226O88253 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10226O88253 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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