Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec11aO88200 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec11aO88200 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms