Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srpk1O70551 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srpk1O70551 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srpk1O70551 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms