Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf5O70191 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atf5O70191 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms