Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtogO55225 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtogO55225 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtogO55225 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtogO55225 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtogO55225 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtogO55225 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtogO55225 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtogO55225 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtogO55225 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtogO55225 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtogO55225 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OtogO55225 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OtogO55225 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OtogO55225 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtogO55225 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms