Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjd2O54851 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gjd2O54851 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjd2O54851 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjd2O54851 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjd2O54851 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjd2O54851 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjd2O54851 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjd2O54851 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjd2O54851 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjd2O54851 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjd2O54851 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjd2O54851 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjd2O54851 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjd2O54851 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjd2O54851 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjd2O54851 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjd2O54851 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjd2O54851 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjd2O54851 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjd2O54851 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjd2O54851 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjd2O54851 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjd2O54851 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjd2O54851 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjd2O54851 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gjd2O54851 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjd2O54851 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd2O54851 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd2O54851 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd2O54851 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gjd2O54851 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd2O54851 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd2O54851 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd2O54851 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd2O54851 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjd2O54851 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjd2O54851 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd2O54851 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd2O54851 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd2O54851 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd2O54851 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd2O54851 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd2O54851 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd2O54851 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjd2O54851 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjd2O54851 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms