Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp10aO54827 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp10aO54827 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp10aO54827 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms