Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sp100O35892 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp100O35892 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Sp100O35892 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sp100O35892 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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