Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PnnO35691 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnnO35691 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnnO35691 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnnO35691 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnnO35691 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnnO35691 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnnO35691 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnnO35691 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnnO35691 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnnO35691 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnnO35691 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnnO35691 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnnO35691 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnnO35691 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnnO35691 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PnnO35691 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PnnO35691 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PnnO35691 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PnnO35691 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PnnO35691 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PnnO35691 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PnnO35691 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnnO35691 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnnO35691 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnnO35691 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnnO35691 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnnO35691 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnnO35691 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnnO35691 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnnO35691 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnnO35691 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnnO35691 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnnO35691 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnnO35691 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnnO35691 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnnO35691 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PnnO35691 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnnO35691 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnnO35691 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PnnO35691 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnnO35691 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnnO35691 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnnO35691 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnnO35691 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnnO35691 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PnnO35691 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnnO35691 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnnO35691 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnnO35691 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnnO35691 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PnnO35691 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PnnO35691 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PnnO35691 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PnnO35691 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms