Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NudcO35685 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NudcO35685 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NudcO35685 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NudcO35685 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NudcO35685 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NudcO35685 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NudcO35685 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NudcO35685 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NudcO35685 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NudcO35685 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NudcO35685 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NudcO35685 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NudcO35685 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NudcO35685 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NudcO35685 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NudcO35685 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NudcO35685 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NudcO35685 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NudcO35685 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NudcO35685 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NudcO35685 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NudcO35685 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NudcO35685 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NudcO35685 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NudcO35685 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NudcO35685 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NudcO35685 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NudcO35685 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NudcO35685 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NudcO35685 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NudcO35685 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NudcO35685 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NudcO35685 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NudcO35685 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms