Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrcpO35427 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CrcpO35427 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrcpO35427 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrcpO35427 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrcpO35427 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CrcpO35427 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms