Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-ObO35424 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms