Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ebi3O35228 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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