Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe40O35185 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe40O35185 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms