Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Polr1aO35134 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Polr1aO35134 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr1aO35134 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms