Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SdcbpO08992 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SdcbpO08992 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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