Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CckarO08786 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CckarO08786 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CckarO08786 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CckarO08786 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CckarO08786 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CckarO08786 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CckarO08786 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms