Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfil3O08750 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nfil3O08750 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms