Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc3aO08576 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc3aO08576 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms