Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp2O08574 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp2O08574 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms