Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3239L7N2D9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3239L7N2D9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms