Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa3bJ9JI28 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa3bJ9JI28 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms