Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm2035J3QP87 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2035J3QP87 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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