Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm20834J3QM72 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm20834J3QM72 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20834J3QM72 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm20834J3QM72 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm20834J3QM72 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm20834J3QM72 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20834J3QM72 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm20834J3QM72 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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