Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6594J3QM43 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm6594J3QM43 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm6594J3QM43 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms