Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm21060J3KMU4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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