Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AK157302I3ITR1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms