Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pabpc4lG5E8X2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pabpc4lG5E8X2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms