Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms