Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r67G5E8C1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r67G5E8C1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms