Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933406M09RikG3XA12 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933406M09RikG3XA12 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933406M09RikG3XA12 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms