Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r58G3X9U3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms