Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf148G3X9R7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms