Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N5

Nxph4, Neurexophilin, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxph4G3X9N5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nxph4G3X9N5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nxph4G3X9N5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms