Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nccrp1G3X9C2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nccrp1G3X9C2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms