Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim55G3X8Y1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms