Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r176G3UW31 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r176G3UW31 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms