Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NpcdF8VQB8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NpcdF8VQB8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms