Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ScaperF8VQ70 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScaperF8VQ70 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms