Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5830473C10RikF8VQ07 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5830473C10RikF8VQ07 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms